Les vastes étendues arides du désert et les rares précipitations dans l’Emirat n’empêchent pas le développement de nombreuses espèces de plantes et d’animaux. L’Emirat abrite environ 3500 plantes endémiques, qui s’adaptent parfaitement à l’importante salinité du sol et à l’environnement difficile.

La flore indigène la plus répandue et la plus cultivée dans l’Emirat et dans tout le pays est le dattier, qui borde délicatement les rues des villes, illumine les jardins des palais, ou crée une mer de feuilles vertes dans les oasis sauvages.

De nombreuses plantes résistantes au sel, que les botanistes appellent halophytes, viennent rompre la monotonie apparente des déserts d’Abu Dhabi. Celles-ci incluent la salsola imbricate, le zygophyllum mandavillei et le tamarix. Certaines herbes comme le panicum turgidum, le pennisetum divisum et le haloxylon salicornicum poussent également dans certaines étendues du désert.

Pour compléter la végétation naturelle de la ville, le gouvernement s’est efforcé, avec des résultats impressionnants, de privilégier la verdure dans la ville d’Abu Dhabi, pour des raisons pratiques et esthétiques. Les jardins paysagers empêchent le sable de souffler sur la route ou dans une autre direction, en particulier en cas de mauvais temps, et fournissent en même temps un environnement verdoyant et calme pour les habitants. Les parcs et les jardins paysagers encouragent également certains animaux comme les oiseaux à migrer et à se reproduire, améliorant ainsi l’écosystème de la ville.

De plus, le désert, avec ses approvisionnements en eau rares, voire inexistants, abrite de nombreuses espèces animales biologiquement constituées pour survivre pendant de longues périodes avec peu ou pas d’eau, dans des conditions climatiques très rudes. La plupart de ces animaux se sont dotés instinctivement de méthodes, leur permettant de s'adapter à leur environnement en « creusant ou en passant de longues périodes nichés dans des trous très profonds, tandis que d’autres s’enterrent rapidement sous la surface du sable non compacté. »

Les reptiles

L’état sauvage du désert convient cependant mieux à un certain groupe d’animaux : les reptiles. Selon les observateurs, c’est le groupe animalier dominant dans le désert ; on peut fréquemment y apercevoir diverses espèces de lézards, y compris les « délicats geckos, les plus robustes dhubs ou lézards à queue épineuse, ainsi que le géant des lézards du désert, le varan, qui peut atteindre un mètre de long ». Plusieurs espèces de serpents cohabitent également dans le désert, y compris la venimeuse vipère à cornes.

Les oiseaux

Incapables de creuser ou d’hiberner (estiver), les oiseaux migrent vers des zones plus accueillantes pour survivre. Les espèces ornithologiques sont moins nombreuses dans le désert d’Abu Dhabi que dans les zones plus tropicales comme l’Asie et l’Afrique. Parmi les espèces d’oiseaux capables de s’adapter au désert, on trouve le sirli du désert, le courvite isabelle et la moinelette à front blanc. On sait également que quelques buses et grands-ducs sont présents dans le désert, tout comme les corbeaux bruns.

Les mammifères

Malheureusement, plusieurs espèces animalières, comme le loup, l’oryx, la hyène rayée et le chacal, ont disparu du désert au cours de ces dernières décennies. Heureusement, deux espèces de gazelles survivent encore : la gazelle des sables et la gazelle des montagnes. La région occidentale de l’émirat d’Abu Dhabi est également connue pour abriter certaines des espèces les plus farouches, sinon nocturnes, présentes dans le désert, comme le chat des sables, le renard de Rüppell, le lièvre du cap et même la gerboise, ainsi que plusieurs espèces de hérissons. On aperçoit encore rarement le léopard arabe et le bouquetin, deux espèces qui se rarifient. Outre ces mammifères en voie de disparition, nocturnes ou farouches, les animaux les plus courants à Abu Dhabi sont les chameaux et les chèvres, qu'il est fréquent de croiser près des routes dans le désert.

La vie aquatique

Les eaux des Émirats Arabes Unis sont connues pour abriter un peu moins de 240 espèces de poissons. Des comptes-rendus indiquent également que quatre espèces de requins menacées à l’échelle mondiale, y compris le requin-baleine, sont présentes dans les eaux d’Abu Dhabi. Moins de 3000 dugongs (vaches marines) peuplent également les mers du pays. Certaines preuves anecdotiques indiquent que cette espèce pourrait se reproduire assez sainement. Abu Dhabi abrite également deux tortues de mer en grand danger de disparition : la tortue imbriquée et la tortue verte. La population de ces deux espèces est estimée à environ 7500 tortues. Il n’est pas rare d’apercevoir également des baleines dans les eaux d’Abu Dhabi.